Namun, dalam pelaksanaannya, program ini dianggap gagal, dengan kritik terhadap Kementerian Pertahanan yang dinilai tidak mampu memperkuat ketahanan pangan dan meningkatkan kesejahteraan petani secara signifikan.
Anggota Komisi I DPR RI TB Hasanudin bahkan telah meminta Badan Pemeriksa Keuangan (BPK) untuk melakukan audit terhadap program Food Estate, berharap hasil audit dapat membuka transparansi anggaran dan mengidentifikasi akar masalah kegagalan program tersebut.
"Daripada kita memperdebatkan hal ini, yang sudah menjadi perdebatan pro dan kontra, dan masalah ini dianggap dipolitisir, lebih baik kita melibatkan BPK," ujar Hasanuddin kepada media pada Senin, 21 Agustus 2023.***